Sekcja „Funkcjonalność historii w późnej nowoczesności” częściowo nawiązuje do programu badawczego Instytutu i jest organizowana we współpracy z Instytutem Filozofii Akademii Nauk Republiki Czeskiej w Pradze. Partnerem drugiej sekcji, która w świetle licznych „setnych rocznic” ma analizować nowe badania i interpretacje pierwszej wojny światowej, jest Instytut Masaryka i Archiwum Czeskiej Akademii Nauk.
Sekcje podczas Zjazdu Czeskich Historyków wpisują się w obecną intensyfikację współpracy z czeskimi instytucjami badawczymi, z których instytuty Czeskiej Akademii Nauk będą odgrywały szczególną rolę.